从内部构造上看也不同，普通电脑一般只有一个主板，上面有CPU插槽，内存槽等标准配置部件，工控机则不同，它有一个较大的母板，也叫无源底板，这块板子上并没有多少集成电路，专业工控机一体机只有较多的扩展槽，带有CPU的主板要插在这个母板上特殊的插槽里，其它的扩展板也要插在母板上，而不是主板上，这样的好处是有了母板可以更好屏幕掉外界的干扰，因为工控机工作的场合有时比较恶劣，干扰比较多，这样就可以使主机更可靠的工作，同时大的母板更也更容易扩展别的插件，这样设计人员在开发系统时可以有更多的选择，而不用考虑是否有空间放下。

工控机在金融行业应用情况，由于金融业的特殊性，因此对设备的稳定性、可靠性有很高的要求，这些一般商业电脑无法满足，专业工控机一体机因此在日常便利设施中都采用了工业控制计算机。例如 ATM、 VTM和自动填充单机的触摸式操作屏幕或内部控制主机都代表着工控机。

普通电脑主要是民用级的，专业工控机一体机在物理环境的要求并不是很多。工控机一般使用在环境比较恶劣的地方，对数据的安全性要求也更高，所以工控机通常会进行加固、防尘、防潮、防腐蚀、防辐射等特殊设计。

工控机供电电压波动大、易停电：现在工业的发展和生活水平的提高，对电量的需求量也日益增大，一些比较偏僻的地区容易出现供电不足的现象，电压不稳。造成工控系统经常重新启动，专业工控机一体机系统重要的日志文件容易丢失而导致无法正常启动。因此工控机工作环境电源的稳定关系到工控机工作正常与否。需要采用稳压电源和UPS不间断电源进行保护，具体设备选型，要依负载功率大小、需保持工作时间多少来定。